Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD4Q96KN9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms