Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG3Q96JB2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG3Q96JB2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms