Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMD4Q96H15 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMD4Q96H15 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms