Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCD1Q96GM5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD1Q96GM5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms