Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms