Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR2Q969E8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms