Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRG4Q92954 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRG4Q92954 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms