Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC148Q8NFR7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms