Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD3Q86VQ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms