Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C12orf54Q6X4T0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms