Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCBE1Q6UXH8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCBE1Q6UXH8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms