Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms