Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q5VSD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms