Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPH4AQ5TD94 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms