Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms