Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms