Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRY2Q49AN0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms