Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF9Q3BBW0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms