Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECM1Q16610 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ECM1Q16610 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECM1Q16610 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ECM1Q16610 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ECM1Q16610 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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