Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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