Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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