Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NCF4Q15080 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCF4Q15080 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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