Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM1Q15032 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
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