Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHPRHQ149N8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHPRHQ149N8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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