Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IHHQ14623 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IHHQ14623 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IHHQ14623 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IHHQ14623 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms