Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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