Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTR4Q13639 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms