Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRQ13535 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRQ13535 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRQ13535 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRQ13535 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRQ13535 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRQ13535 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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