Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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