Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHD3Q12873 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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