Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR1Q08345 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms