Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms