Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms