Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN7AQ01118 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms