Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IP78347 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms