Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms