Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSBP53539 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSBP53539 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms