Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACLYP53396 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACLYP53396 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACLYP53396 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACLYP53396 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACLYP53396 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms