Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP1P53367 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP1P53367 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms