Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERFP50548 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERFP50548 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERFP50548 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERFP50548 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERFP50548 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERFP50548 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms