Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTBP49356 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTBP49356 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTBP49356 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms