Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC1P48995 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms