Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms