Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCAMP43121 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCAMP43121 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms