Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms