Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FLT4P35916 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FLT4P35916 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT4P35916 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT4P35916 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT4P35916 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms