Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms