Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms