Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YY1P25490 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YY1P25490 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YY1P25490 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YY1P25490 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YY1P25490 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YY1P25490 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms