Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATP2B4P23634 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms